Un samouraï sans maître parcourt le Japon féodal en compagnie de son petit garçon. Il a pour nom Ogami
Itto, et il était autrefois l'un des hommes les plus importants du pays. Mais un complt lui a fait perdre son pouvoir et son prestige. Pour prendre sa revanche, il a choisi de devenir assassin et de louer ses services. Aussi forme-t-il avec son fils Daigoro, le duo Lone Wolf & Cub (le Loup Solitaire et son Petit).
Ogami Itto souhaite maintenant rejoindre Edo, la capitale. Là-bas il espère pouvoir se venger une fois pour toute de Yagyu Retsudo. "Chasse-le, tue-le avant la fin du mois...ou ta tête tombera" déclare le Shogun alors qu'il intervient personnellement et pour la première fois dans le duel entre le vieux conspirateur et l'ancien bourreau. Bien des adversaires attendent encore le ronin et son enfant sur la route...